Sequenciador de Nova Geração

Nome do Equipamento:

SEQUENCIADOR DE NOVA GERAÇÃO (NGS) – modelo Nextseq1000 System

Descrição do Equipamento:

O equipamento multiusuário (EMU) SEQUENCIADOR DE NOVA GERAÇÃO (NGS) modelo NextSeq1000 System, concedido com recursos do Convênio FINEP/FAPEAD/UEMA Ref. – 0643/24, está instalado no Laboratório de Equipamentos Multiusuários da Universidade Estadual do Maranhão, Campus Caxias.

O SEQUENCIADOR DE NOVA GERAÇÃO (NGS) modelo NextSeq1000 System é um equipamento para sequenciamento genético de nova geração com capacidade de geração de dados de 240 gb (400 milhões de reads) por corrida, com dados em alta qualidade (>85% de Q30, ou seja, pelo menos 85% das bases sequenciadas com valor de qualidade (QV) superior a 30) em qualquer corrida. Inclui tela sensível ao toque, computador no instrumento, periféricos e software para configuração e monitoramento das corridas no instrumento com o hardware Dragen Bio-IT, tem conexão automática com BaseSpace que é a nuvem de armazenamento e gerenciamento de dados que também é uma exclusividade da ILLUMINA.

Este equipamento sequencia fragmentos nas modalidades single-end ou paired-end de forma totalmente automatizada, podendo variar de 100 pb (2×50 pb) a 600 pb (2×300 pb), permite análise de grandes painéis gênicos ou exomas e permite a análise de sequenciamento de transcriptomas com o intuito de avaliar a expressão gênica, RNA-Seq total, mRNA-seq, miRNA e smallRNA. Tem a capacidade de gerar análises de dados secundárias, como demultiplexação e trimagem, no próprio equipamento.

O NextSeq1000 System (NGS) é utilizado em diversas áreas científicas devido à sua alta resolução e versatilidade. Principais áreas de emprego do NGS: Ciências Biológicas, Ciências da Saúde, Ciências Agrárias, sendo amplamente empregado na medicina, pesquisa biológica e agropecuária para ler milhões de fragmentos de DNA/RNA simultaneamente. Ele serve para a identificação rápida de patógenos (vírus, bactérias, fungos), vigilância genômica de variantes (como SARS-CoV-2) e estudo da resistência a antibióticos, sequenciamento de exoma ou genoma para diagnosticar doenças genéticas complexas ou raras em pacientes com sintomas inespecíficos, seleção de características desejáveis e controle de patógenos agrícolas, estudo da diversidade microbiana, expressão gênica e estudos evolutivos.

Laboratório:

Laboratório de Equipamentos Multiusuários do Campus Caxias

Universidade Estadual do Maranhão

Normas de Uso do equipamento: Sequenciador NGS – Normas de Uso do Equipamento Multiusuário_UEMA_PPG

Formulário de Agendamento de Equipamento Multiusuário – SEQUENCIADOR DE NOVA GERAÇÃO (NGS) – modelo Nextseq1000 System (UEMA – LEMC/Campus Caxias):  https://forms.gle/P6D5JwfLTd8HUxKG6

Coordenador:

Maria Claudene Barros

Contato: equip.multiuso.uema.caxias@gmail.com